Detuvieron al presidente Michel Kafando y al primer ministro Isaac Zida.
Burkina Faso debía celebrar elecciones en octubre próximo.
Kafando y Zida fueron llevados a un centro de detención.
Militares del Ejército de Burkina aseguraron este jueves que han tomado el control del país y que el presidente, Michel Kafando, que desde el miércoles permanece retenido a la fuerza por la guardia presidencial, ha renunciado.
Un militar leyó una declaración en la televisión estatal, la RTB, en nombre del denominado Consejo Nacional de la Democracia (CND) y agregó que el Gobierno de transición ha sido disuelto.
"Las fuerzas patrióticas y democráticas, compuestas por todos los sectores de las nación y reunidas en el seno del CND, han decidido terminar con el régimen de la transición", afirmó.
Ayer, durante el Consejo de Ministros, Kafando y el primer ministro, Isaac Zida, fueron tomados "como rehenes" por la guardia presidencial y posteriormente fueron trasladados a un campamento militar en la capital, Uagadugú.
En su declaración, el militar también condenó la gestión realizada por el Gobierno de transición y las medidas adoptadas, incluidas las de la ley electoral, que rechaza las candidaturas de los afines al ex presidente Blaise Compaoré, que dimitió y huyó tras protestas masivas a finales del año pasado.
"La ley electoral, hecha a medida para ciertos individuos y denunciada por las autoridades y las organizaciones de derechos humanos, se camufla como una herramienta para negar a nuestro pueblo de unos valores fundados en el espíritu de la justicia, la igualdad y la tolerancia", dijo el militar.
"Esta ley crea una división y una grave frustración en el pueblo porque instaura dos clases de ciudadanos", añadió.
Burkina Faso estaba llamada a celebrar elecciones en octubre para poner fin a la transición civil iniciada hace un año, tras las protestas que pusieron fin a casi tres décadas de dictadura de Blaise Compaoré, tras el asesinato del ex presidente Thomas Sankara.
